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石碧

发布于:2022-08-29 星期一 10:21:33  点击数:2277

博士、教授、博士生导师、岳麓学者

2022年国家级海外高层次人才计划青年项目入选

E-mail: bishi@hnu.edu.cn

基本信息

       石碧,博士、教授、博士生导师、湖南大学岳麓学者。2018年4月至2022年7于美国弗吉尼亚大学先后担任肿瘤医学副研究员和研究科学家;2014年10月至2018年3月在美国阿拉巴马大学伯明翰分校从事免疫学博士后研究;主要研究表观遗传和转录因子等对免疫反应和肿瘤发生发展所进行的调控。近年来以第一作者或共同第一作者Nature,  Nature Cell Biology,  Journal of Immunology,  American Journal of Reproductive Immunology等国际学术期刊上发表SCI论文多篇。



       

     招生招聘信息:

      1、研究生(每年招收1-2名博士研究生和3名硕士研究生。2023年博士指标尚未确定。截至10/24/2022,2023年硕士指标剩余3名,有意者请附简历与其他材料邮件联系。来信48小时内必回);

      2、博士后(常年招收博士后,入选者年薪25万元起,上不封顶,有意者请附简历与其他材料邮件联系。来信48小时内必回

      3、研究系列岗位(研究员、副研究员、助理研究员与研究助理。10/24/2022,实验室有意招收助理研究员2名,要求具有本科或硕士学历,有意者请附简历和相关材料邮件联系。来信48小时内必回);

      有意者请将个人简历发送至bishi@hnu.edu.cn 


教育背景

      09/2009–09/2014   博士,犹他州立大学,免疫遗传学

      09/2004–06/2009   学士,华中农业大学,动物医学


工作履历

       08/2022-                  肿瘤医学  教授/博导      湖南大学

       04/2021 - 07/2022   肿瘤医学  研究科学家   弗吉尼亚大学

       04/2018 - 03/2021   肿瘤医学  副研究员       弗吉尼亚大学        

       10/2014 - 03/2018   免疫学      博士后           阿拉巴马大学伯明翰分校    


研究领域

 课题组将以体外培养细胞和小鼠为对象, 将综合运用生物化学,分子生物学,免疫学,基因编辑和生物信息学等不同技术手段研究肿瘤发生过程中分子病理机制,并筛选出可以通过对蛋白质相变进行干扰来抑制癌细胞生长的功能小分子。 

主要从以下四个方面进行研究:

       1、T细胞在肿瘤发生发展中失能机制;

       2、蛋白质相分离异常导致癌症发生病理机制;

       3、新的原癌基因与抑癌功能性基因发掘;

       4、开发单克隆抗体、纳米抗体、小分子等潜在肿瘤治疗手段。


学术成果

课题组主要利用免疫、生化、细胞学技术和多组学结合来研究启动子-增强子环化、RNA可变剪接和经典转录因子-启动子结合等对免疫反应和肿瘤发生发展进行的表达调控,取得了以下主要成果:

       1、报道了UTX通过相分离凝聚MLL4P300来实现对增强子的表观遗传修饰以及染色质三维结构的改变,从而调控基因的表达以发挥其抑癌和维持正常发育的作用 (Nature 2021)

       2、揭示了核蛋白AKAP95在合适的凝聚体生物物理属性范围内通过液液相分离调控RNA可变剪接和肿瘤生成(Nat. Cell Biol. 2020)。

       3、阐述了转录因子在启动子上的结合对T细胞激活分化(J.Immunol. 2016J. Immunol. 2018)以及母婴界面胚胎滋养层细胞MHC-I表达的调控机制(Am. J. Reprod. Immunol. 2018) 


      代表性研究论文(#同等贡献第一作者

       1.     Bi Shi#, Wei Li#, Yansu Song#, Zhenjia Wang#, Rui Ju, Aleksandra Ulman, Jing Hu, Francesco Palomba, Yanfang Zhao, John Philip Le, William Jarrard, David Dimoff, Michelle A. Digman, Enrico Gratton, Chongzhi Zang, and Hao Jiang. UTX condensation underlies its tumour-suppressive activity. Nature. 2021, 597, 726–731.

       2.     Wei Li#, Jing Hu#Bi Shi#, Francesco Palomba, Michelle A Digman, Enrico Gratton, Hao Jiang.  Biophysical properties of AKAP95 protein condensates regulate splicing and tumorigenesis. Nature Cell Biology. 2020, Jul 27; (22) 960–972.

       3.     Bi Shi#, Wei Li & Hao Jiang. Epigenetic condensates regulate chromatin activity and tumorigenesis. Molecular & Cellular Oncology.  2021, 8:5.

       4.     Bi Shi#, Jianlin Geng#, Yinhu Wang, Hairong Wei, Beth Walters, Wei Li, Xuerui Luo, Anna Stevens, Melanie Pittman, Bin Li, Sunnie R. Thompson, Hui Hu. Foxp1 negatively regulates T follicular helper cell differentiation and germinal center response by controlling cell migration and CTLA-4. Journal of Immunology. 2018 Jan 15;200(2):586-594

       5.     Bi Shi#, Aaron J. Thomas, Abby D. Benninghoff, Benjamin R. Sessions, Qinggang Meng, Parveen Parasar, Heloisa Rutigliano, Kenneth L. White and Christopher J. Davies. Genetic and epigenetic regulation of major histocompatibility complex class I gene expression in bovine trophoblast cells. American Journal of Reproductive Immunology.  2018, DOI: 10.1111/aji.12779.

       6.     Alexander Dalecki, Braxton Greer, Alexandra Duverger, Elan Strange, Eric Carlin, Frederic Wagner, Bi Shi, Mildred Perez, Christopher Tidwell, Katarzyna Kaczmarek Michaels, Sophia Giattina, Stefan Bossmann, Andrew Henderson, Hui Hu, and Olaf Kutsch. Host cell dedifferentiation and metabolic reprogramming drive HIV-1 latency stability. Journal of Virology. 2022 , doi/10.1128/jvi.01974-21.

       7.   Kushani K Shah, Robert H Whitaker, Theodore Busby, Jing Hu, Bi Shi, Zhenjia Wang, Chongzhi Zang, William J Placzek, Hao Jiang.  Specific inhibition of DPY30 activity by ASH2L-derived peptides suppresses blood cancer cell growth. Experimental Cell Research. 2019 Sep 15; 382(2):111485.

       8.   Jianlin Geng , Hairong Wei, Bi Shi, Yin-Hu Wang , Braxton D Greer, Melanie Pittman , Emily Smith , Paul G Thomas , Olaf Kutsch , Hui Hu.  Bach2 Negatively Regulates T Follicular Helper Cell Differentiation and Is Critical for CD4 + T Cell Memory. Journal of Immunology. 2019 May 15; 202 (10):2991-2998.

       9.     Hairong Wei, Jianlin Geng, Bi Shi, Zhenghui Liu, Yinhu Wang, Anna Stevens, Stephanie Sprout, Min Yao, Haikun Wang, Hui Hu. Cutting Edge: Foxp1 controls naive CD8+ T cell quiescence by simultaneously repressing key pathways in cellular Metabolism and Cell Cycle Progression. Journal of Immunology. 2016 May 1;196(9):3537-41.  

       10.  Parveen Parasar, Amanda Wilhelm, Heloisa Rutigliano, Aaron J. Thomas, Lihong Teng, Bi Shi, William C. Davis, Carlos Suarez, Daniel New, Kenneth L. White, Christopher J. Davies. Expression of bovine non-classical major histocompatibility complex class I proteins in mouse P815 and human K562 cells. Research in Veterinary Science. 2016 Aug; 107:161-70. doi: 10.1016/j.rvsc.2016.06.004.

       11.  Heloisa Rutigliano, Amanda Wilhelm, Justin Hall, Bi Shi, Qinggang Meng, Rusty Stott, Thomas D. Bunch, Kenneth L. White, Christopher J. Davies, Polejaeva I. Cytokine gene expression at the maternal-fetal interface after somatic cell nuclear transfer pregnancies in small ruminants. Reproduction, Fertility and Development. 2015 Oct 14. doi: 10.1071/RD15103.

      12.  Zhiqiang Fan, Wei Li, Sang R. Lee, Qinggang Meng, Bi Shi, Thomas D. Bunch, Kenneth L.White, Kong IK, Zhongde Wang. Efficient Gene Targeting in Golden Syrian Hamsters by the CRISPR/Cas9 System. PLoS One. 2014 Oct 9;9(10):e109755.

      13.  Qiyun Xie, Hui Jin, Rui Luo, Yun Wan, Jie Chu, Hufeng Zhou, Bi Shi, Huanchun Chen and Rui Zhou. Transcriptional responses of Haemophilus parasuis to iron-restriction stress in vitro. Biometals. 2009, 22:907–916.

      14.  Bi Shi, Yaowen Cui, Fan Jia, Hui Jin, Yun Wan, Xuwang Cai, Gang Fang, Huanchun Chen, Rui Zhou. Establishment of indirect haemagglutination and indirect ELISA assays for detection of antibodies against Heamophilus parasuis serotype 5. Veterinary Science in China. 2007, 37 (11): 946-968.  (Published in Chinese)


奖励与荣誉

2013年国际繁殖免疫学会“青年科学家”奖

2022年国家留学基金委“优秀自费留学生”奖

2022年湖南大学新教师微格演练一等奖

2022年入选国家级海外高层次人才计划青年项目