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于峰

发布于:2018-10-18 星期四 10:12:10 点击数:14143

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  于峰

  教授、博士生导师、副院长

  电话/微信: 13055164913

  邮箱: feng_yu@hnu.edu.cn








基本信息

1984年3月出生于湖南永州,湖南大学生物学院教授,博士生导师,副院长。化学生物传感与计量学国家重点实验室PI (2017)。湖南省优秀博士学位论文(2015)。湖南师范大学获生物技术学士学位(2007年)、理学博士学位(2013年,导师:陈良碧、栾升(UCB)教授)。加州大学伯克利分校大数据分析方向访问学者(2017.12-2018.12,合作导师Devin Coleman-Derr),在Science Advances,Molecular Plant,PNAS,PLOS Biology等杂志发表论文多篇。主持国家自然科学基金项目3项。

教育背景

2003-2007 湖南师范大学 生物技术专业 本科

2008-2013 湖南师范大学 硕博连读生,导师:陈良碧, 栾升教授

2017-2018 加州大学伯克利分校 生物信息与大数据,访问学者,合作导师:Devin Coleman-Derr


EDUCATION

2003-2007   B.Sc., Biology, Hunan Normal University, Changsha, Hunan, China.

2008-2013   Ph.D., Plant Biology, Hunan Normal University, Changsha, Hunan,China.

Supervisors: Prof. Sheng Luan (UC Berkeley) and Prof. Liangbi Chen (Hunan Normal University).

2017-2018 Visiting Scholar,Bioinformatics and big data, University of California, Berkeley. Working with Dr. Devin Coleman-Derr.

工作履历

2013-2017            副教授,湖南大学生物学院

2017-2018            研究员,湖南大学生物学院 

2018-                    教授,湖南大学生物学院

2016.04-2018.03  湖南大学生物学院生命科学支部书记

2018.04-2019.03  湖南大学生物学院院长助理

2019.04-             湖南大学生物学院副院长

2019.12-             湖南大学发展规划办公室(重点建设办公室)副主任(挂职)


PROFESSIONAL EXPERIENCE

2013- 2017  Associate Professor, Hunan University, College of Biology, Changsha, Hunan, China

2017- 2018  Research Professor, Hunan University, College of Biology, Changsha, Hunan, China

2018-2019   Professor, Assistant Dean, Hunan University, College of Biology, Changsha, Hunan, China

2019-now    Professor, Associate Dean, Hunan University, College of Biology, Changsha, Hunan, China

学术兼职

为Nature Plants, Cell Research, Molecular Plant, PLOS Biology, BMC Plant Biology等杂志审稿;现为《植物生理学报》、《生命科学研究》杂志编委;中国遗传学会青年委员会委员、中国细胞生物学学会植物器官发生委员会委员、湖南省遗传学会副理事长、湖南省植物学会理事、中国植物蛋白质组学工作组理事。

研究领域

2013年11月组建“细胞适应性机制”(Basis of Cell Adapation)研究团队, 简称BCA。BCA小组围绕细胞环境适应性机制这个基础科学问题,利用多学科交叉手段,以拟南芥、水稻、烟草、线虫、真菌等模型,围绕以下三个相互关联的方向探索:


一、类受体激酶(Receptor-like kinase,RLK)RLK是植物中最大的一类受体蛋白,感受外界信号动态变化,调控植物生长与存活的方方面面。继1990年克隆第一个RLK成员开始,近三十年里围绕RLK的工作机制已经取得诸多重要进展。BCA聚焦RLK成员FERONIA的信号网络,揭示了几个RLK的新工作范式(1)RLK调控RNA代谢。阐明FERONIA调控mRNA翻译(Zhu et al., Molecular Plant, 2020)、可变剪切(Wang et al., Science Advances, 2020)的机制和功能;(2)RLK通过一步法直接调控核内基因表达(Li et al., PLOS Biology, 2018)。

基于此,拟进一步利用FERONIA等RLK为模型,系统探索RLK的功能、激活和去孤儿化等基础问题。力图建立新的RLK工作范式。

 

二、环境响应的RNA代谢。植物环境适应性既往研究着重关注细胞如何感受并调控DNA转录和蛋白翻译后修饰层面的相关机制。BCA小组建立了几个外界信号如何调控mRNA翻译,可变剪切等通路/模型,在植物中首次提出了mRNA原位/极性翻译概念(reviewed in Zhu et al., New Phytologist, 2020)。拟继续探究内、外界信号如何动态调控RNA的时空特异性分布、翻译、可变剪切、稳定性等基础问题。

 

三、信号的细胞/组织特异性输出与农艺性状整合。优良农艺性状的聚合需要考虑不同信号之间的交流与平衡输出问题。前期发现FERONIA信号网络具有典型的组织和细胞特异性(reviewed in Chen et al., aBIOTECH, 2020),并影响多种生物与非生物逆境响应(Yu et al., PNAS, 2012; Chen et al., PNAS, 2016)、能量代谢、作物产量和品质等农艺性状(Yu et al., Molecular Plant, 2014, Yang et al., 2020, JXB)。

拟以FERONIA等RLK为模型,探究配体/受体分子对的产生、共进化,及其结合特异性的机理;信号转导的组织/细胞特异性及信号强度调控机理等基础问题。并将以上理论认识,实践于优良农艺性状聚合的研究中。


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                                                                                                          BCA小组被封面推荐的研究工作


BCA小组运行理念:

 

BCA小组大力鼓励、积极拥抱、并不断开拓跨学科的手段和研究模型。目前已经在小组运用的主要手段包括分子生化、细胞遗传、大数据与机器学习、结构生物学、化学生物学、材料学等。

 

BCA欢迎跨学科背景的学生加入!同时全力支持有志向、有想法的博士后和青年科研人员利用本小组平台发展、壮大自己!并积极寻求平等、互利的合作研究!

 

BCA小组人才培养的理念是:培养身心健康的三有青年(有态度,有理想,有成果)。每年招收硕士生2-3名,博士生1-2名,博士后2-3名(全年均可入站)。

2021年招收多名硕士推免生,请感兴趣者邮件或者微信联系。


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科研项目

1.     国家自然科学基金面上项目,31871396、一个核质穿梭蛋白在FERONIA信号网络中的功能、2019/01-2022/12、69 万元、在研、主持。

2.       国家自然科学基金面上项目31571444受体蛋白激酶FERONIA响应RALF多肽信号的机制、2016/01-2019/12、77.8万元、在研、结题。

3.      国家自然科学基金青年项目31400232磷酸酶ABI2在受体蛋白激酶FERONIA调控脱落酸与逆境响应中的分子机制研究2015/01-2017/12、24万元、结题、主持。

4.       中国科协“青年人才托举计划”,YESS20160001、FERONIA信号网络在植物与微生物互作中的作用研究、2016/01-2018/12、45万、结题、主持。

5.       湖南省自然科学基金青年项目2015JJ3048、受体蛋白激酶FERONIA在乙烯合成中的功能分析2015/01-2017/12、5万元、结题、主持。

6.       湖南省优秀博士论文项目受体蛋白激酶FERONIA在RALF与ABA交叉会话中的作用2015/01-2016/12、2万元、结题、主持。

7.       湖南大学教改项目基于《微生物与人类健康》的MOOC教学研究2015/01-2017/12、0.5万元、结题、主持

学术成果

以第一或通讯作者身份发表论文 (第一作者标“#”,通讯作者标“*”)

Publications (As the first or corresponding author)

1.       Yu F#, Shi J#, Zhou JY#, Gu JL, Chen QH, Li J, Cheng W, Mao DD, Tian LF, Buchanan B*, Li LG, Chen LB, Li DP*, Luan S* (2010) ANK6, a Mitochondrial Ankyrin Repeat Protein, is Required for Male-female Gamete Recognition in Arabidopsis thaliana. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 107: 22332–22337.

2.       Yu F, Qian LC, Nibau C, Duan QH, Kita D, Levasseur K, Li X, Lu CQ, Li H, Hou CC, Li LG, Buchanan BB*, Chen LB*, Cheung A, Li DP*, Luan S* (2012) FERONIA Receptor Kinase Pathway Suppresses Abscisic Acid Signaling in Arabidopsis by Activating ABI2 Phosphatase. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 109: 14693-14698. 

3.       Yu F, Li J, Huang Y, Liu L, Li DP*, Chen LB*, Luan S* (2014a) FERONIA Receptor Kinase Controls Seed Size in Arabidopsis thaliana. Molecular Plant 7:920-922. 

4.       Yu F#, Tian W#, Luan S* (2014b) From Receptor-Like Kinases to Calcium Spikes: What Are the Missing Links?Molecular Plant 7:1501-1504.

5.       Yu DS#, Yu F#, Du CQ, Li XS, Zhao XY*, Liu XM* (2015) RPN1a, a Subunit of the 26S Proteasome, Controls Trichome Development in Arabidopsis. Plant Physiology and Biochemistry 88:82-88.

6.       Mao DD#, Yu F*#, Li J, Van de Poel B, Tan D, Li JL, Liu Y, Li XS, Dong MQ, Chen LB, Li DP, Luan S* (2015) FERONIA Receptor Kinase Interacts with S-adenosylmethionine Synthetase and Suppresses S-adenosylmethionine Production and Ethylene Biosynthesis in Arabidopsis. Plant, Cell & Environment 38:2566-2574. 

7.       Yang T#, Wang L#, Li CY, Liu Y, Zhu SR, Qi YY, Liu XM, Lin QL*, Luan S, Yu F* (2015) Receptor Protein Kinase FERONIA Controls Leaf Starch Accumulation by Interacting with Glyceraldehyde-3-Phosphate Dehydrogenase. Biochemical and Biophysical Research Communications 465:77-82.

8.       Chen J#, Yu F*#, Liu Y, Du CQ, Li XS, Zhu SR, Wang XC, Lan WZ, Rodriguez PL, Liu XM, Li DP, Chen LB, Luan S* (2016) FERONIA Interacts with ABI2-type Phosphatases to Facilitate Signaling Cross-talk Between Abscisic Acid and RALF Peptide in Arabidopsis. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America113:E5519-E5527. 

9.       Yu DS#, Li XS#, Zhao XY#, Du CQ, Chen J, Li CY, Sun MS, Wang L, Lin JZ, Tang DY, Yu F*, Liu XM* (2016) RPN1a Negatively Regulates ABA Signaling in Arabidopsis. Plant Physiology and Biochemistry 108:279-285.

10.    Yu F, Luan S* (2016) Peptide Signaling in Plants: Finding Partners is the Key.Cell Research 26:755-756.

11.    Du CQ#, Li XS#, Chen J#, Chen W, Li B, Li CY, Wang L, Li JL, Zhao XY, Lin JZ, Liu XM*, Luan S*, Yu F* (2016) Receptor Kinase Complex Transmits RALF Peptide Signal to Inhibit Root Growth in Arabidopsis. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 113:E8326-E8334. 

12.    Li CY#, Wang L#, Cui YC, He LM, Qi YY, Zhang JX, Lin JZ, Liao HD, Lin QL, Yang T, Yu F*, Liu XM* (2016) Two FERONIA Like Receptor Genes (FLR) are Required to Maintain Architecture, Fertility and Seed Yield in Rice. Molecular Breeding 36: 151-162.

13.    Yu F (2017) Molecular Mechanism of Cross-talk Between Abscisic Acid and RALF Peptide in Arabidopsis. Science Foundation in China 4:50-50.

14.    Liao HD, Zhang X, Tang RJ, Luan S*, Yu F* (2017) FERONIA Receptor Kinase at the Crossroad of Hormone Signaling and Stress Responses. Plant and Cell Physiology 58: 1143-1150.

15.    Lu CQ#, Yu F#, Tian LF#, Huang XY, Tan H, Xie ZJ, Hao XH, Li DP*, Luan S*, Chen LB* (2017) RPS9M, a Mitochondrial Ribosomal Protein, Is Essential for Central Cell Maturation and Endosperm Development in Arabidopsis. Frontiers in Plant Science 8:2171.

16.    Li CY#, Liu XM#, Qiang XN, Li XY, Li XS, Zhu SR, Wang L, Wang Y, Liao HD, Luan S, Yu F* (2018) EBP1 Nuclear Accumulation Negatively Feeds Back on FERONIA-Mediated RALF1 Signaling. PLOS Biology 16: e2006340.  Weekly cover story

Highlighted by Stegmann M (2018) EBP1: A crucial growth regulator downstream of receptor kinases across kingdoms. PLOS Biology 16: e3000056.

17.    于峰2019)受体激酶——植物环境适应性的调节枢纽。生物技术通报 35:1.

18.    强晓楠,李鑫,陈佳,廖红东,于峰* 2019)拟南芥RALF多肽家族的功能多样性初步分析。生物技术通报 35:2-10. (封面论文)

19.    Xu GY#, Chen W#, Song L, Chen Q, Zhang H, Liao H, Zhao G, Lin F, Zhou H*, Yu F*. (2019) FERONIA phosphorylates E3 ubiquitin ligase ATL6 to modulate the stability of 14-3-3 proteins in response to the carbon/nitrogen ratio. Journal of Experimental Botany 70:6375-6388.

20.    Yang ZH#, Xing JJ#*, Wang  L#, Liu Y, Qu JN, Tan Y, Fu XQ, Lin QL, Deng HF*, Yu F*. (2020) Mutations of Two FERONIA-like Receptor Genes Enhance Rice Blast Resistance without Growth Penalty. Journal of Experimental Botany. 6:2112-2126.

21.    Wang L#, Yang T#, Lin QL*, Wang BQ, Li X, Luan S, Yu F*. (2020) Receptor Kinase FERONIA Regulates Flowering Time in Arabidopsis. BMC Plant Biology. 20:26.

22.    Zhu SR#, Estevez JM#, Liao HD, Zhu YH, Yang T, Li CY, Wang YC, Li L, Liu XM, Pacheco M, Guo HW, Yu F*. (2020) The RALF1–FERONIA Complex Phosphorylates eIF4E1 to Promote Protein Synthesis and Polar Root Hair Growth. Molecular Plant. 13:698-716. Cover Story

Highlighted by Marjorie Guichard (2020) On-site Manufacturing in Tip-growing Cells Through RALF1-FERONIA-Mediated Local mRNA Translation. Molecular Plant. 13:682-684.

23. Zhu SR#, Pacheco M#, Estevez JM*, Yu F*. (2020) Autocrine Regulation of Root Hair Size by the RALF-FERONIA-RSL4 Signaling Pathway. New Phytologist. doi: 10.1111/nph.16497.

24.  Chen J, Zhu SR, Ming ZH, Liu XM*, Yu F* (2020) FERONIA Cytoplasmic Domain: Node of Varied Signal Outputs. aBIOTECH. 1:135-146.

25. Wang L#, Yang T#, Wang BQ, Lin QL*, Zhu SR, Li CY, Ma YC, Tang J, Xing JJ, Li XS, Liao HD, Staiger D, Hu ZQ, Yu F* (2020) RALF1-FERONIA Complex Affects Splicing Dynamics to Modulate Stress Responses and Growth in Plants. Science Advances. 6.eaaz1622.

26. Yu M, Li RL, Cui YN, Chen WJ, Li B, Zhang X, Bu YF, Cao YY, Xing JJ, JEWARIA, PK Li XJ, Bhalerao R, Yu F*, Lin JX* (2020) The RALF1-FERONIA Interaction Modulates Endocytosis to Mediate Control of Root Growth in Arabidopsis. Development. In Press.

27. Zhang X#, Yang ZH#, Wu DS, Yu F* (2020) RALF-FERONIA Signaling: Linking Plant Immune Response with Cell Growth. Plant Communications. In Press.


合作发表论文 (As the collaborative author)


1.       Zhou Y, Liu C, Tang D, Yan L, Wang D, Yang Y, Gui J, Zhao XY, Li L Tang XD, Yu F, Li JL, Liu LL, Zhu Y, Lin J, Liu XM (2018) The Receptor-like Cytoplasmic Kinase STRK1 Phosphorylates and Activates CatC, thereby Regulating H2O2 Homeostasis and Improving Salt Tolerance in Rice. The Plant Cell 30:1100-1118.

2.       Li Y, Lin J, L Li, Peng Y, Wang W, Zhou Y, Tang D, Zhao X, Yu F, Liu XM (2016) DHHC-cysteine-rich Domain S-acyltransferase Protein Family in Rice: Organization, Phylogenetic Relationship and Expression Pattern during Development and Stress. Plant Systematics and Evolution 302: 1405-1417.

3.       Zeng S, Liu D, Li C, Yu F, Fan L, Lei C, Huang Y, Nie Z, Yao SZ (2018) A Cell Surface-Anchored Ratiometric DNA Tweezer for Real Time Monitoring of Extracellular and Apoplastic pH. Analytical Chemistry. 90:13459-13466.

4. Lu CQ, Xie Z, Yu F, Tian LF, Hao XH, Wang XH, Chen LB, Li DP (2020) Mitochondrial Ribosomal Protein S9M is Involved in Male Gametogenesis and Seed Development in Arabidopsis. Plant Biology. doi: 10.1111/plb.13108.

奖励与荣誉

2017  湖南大学“优秀教师”

2017  湖南大学“优秀共产党员”

2015  湖南省优秀博士论文

2013  湖南省优秀毕业生

2013  首届研究生国家奖学金 (博士)

2012  湖南省芙蓉学子-学术科研奖